Unter dem Motto „Natur, Mensch und Harmonie“ präsentiert das Shanghai Natural History Museum zehn permanente Ausstellungsbereiche wie „Das Geheimnis der Ursprünge“ und „Der Fluss des Lebens“ anhand der drei Hauptlinien „Die Bewegung der Evolution“, „Die Bilderrolle des Lebens“ und „Das Epos der Zivilisation“. Es werden mehr als 11.000 Exemplarmodelle aus den sieben Kontinenten gezeigt und ausgestellt. Außerdem gibt es einen 300 Quadratmeter großen Bereich für lebende Zuchttiere und ein 1.200 Quadratmeter großes Erkundungszentrum. Im 2. Stock befinden sich die Halle „Das Geheimnis der Ursprünge“, ein 4D-Kino und ein Restaurant. Im 1. Stock zeigt die Halle „Der Fluss des Lebens“ verschiedene biologische Fossilien und Exemplare aus der langen Geschichte. Auf B1 befinden sich die Hallen „Der Weg der Evolution“ und „Der Weg in die Zukunft“. Sie können auch die Ausstellungshallen in den beiden anderen Stockwerken erkunden.