Das Museum befindet sich am Standort von Schindlers Fabrik, die im Oscar-prämierten Film „Schindlers Liste“ von Steven Spielberg dargestellt wird, und bietet eine ergreifende Darstellung der Kriegsgeschichte Krakaus. Durch die modernen und eindringlichen Ausstellungen erhalten die Besucher Einblick in das tägliche Leben und die tragischen Ereignisse des Zweiten Weltkriegs.

Krakaus markanteste Erinnerung an sein Ghetto ist ein 12 Meter langer Abschnitt der ursprünglichen Ghettomauer. Eine 1983 errichtete Gedenktafel auf Hebräisch und Polnisch trägt die Inschrift: „Hier lebten sie, litten und starben durch die Hände der deutschen Folterer. Von hier aus begannen sie ihre letzte Reise in die Todeslager.“

Der Platz der Helden des Ghettos im Krakauer Stadtteil Podgórze diente von 1941 bis 1943 als Versammlungsort für die jüdische Bevölkerung vor ihrer Deportation in Konzentrationslager. Heute ist der Platz mit einem ergreifenden Denkmal geschmückt: mehrere Dutzend gusseiserne Stühle, die überall verstreut stehen. Diese Stühle symbolisieren die Besitztümer der Krakauer Juden, die nach der Liquidierung des Ghettos auf den Straßen zurückgelassen wurden.