Selon certains chercheurs, le nom de Tipón pourrait provenir du mot « T Olímpuj », qui signifierait « bouillant ». Ce nom serait directement lié à l'eau des sources du complexe, d'où son surnom de « Temple de l'Eau ». Selon certains historiens et mythes, ce site aurait été construit par l'Inca Wiracocha, et abriterait la « Maison Royale », créée pour abriter le père de cet Inca : Yawar Huaca.

Piquillacta, ou Pikillaqta, est l'un des sites pré-incas les plus célèbres et les mieux préservés des cités antiques du Pérou. On y trouve également plusieurs anciens établissements humains, chacun doté de connaissances et de technologies spécifiques, qui ont contribué à l'établissement du plus grand empire de l'hémisphère occidental. Les peuples pré-incas qui occupaient la vallée de Cuzco étaient relativement pacifiques ; ils cherchaient à dominer les ressources naturelles de la région et à étendre leur culture. Piquillacta a été développée entre 600 et 1000 après J.-C. par la culture Wari des Andes centrales (Ayacucho). Elle s'est ensuite étendue vers le sud, s'implantant dans les hautes régions andines comme Cuzco et Sicuani, puis dans les vallées occidentales de la côte sud d'Arequipa.

Elle fut construite au XVIe siècle sur un ancien édifice inca, dont les fondations sont encore conservées. L'extérieur de l'église, typique des églises coloniales andines, n'attire guère l'attention : la chapelle en forme de balcon et le clocher carré sur un côté. Mais c'est l'intérieur qui impressionne le visiteur. La décoration typiquement baroque, avec ses peintures, sculptures et gravures, ne laisse pratiquement aucun espace inoccupé. Sur l'arche d'entrée du baptistère, on peut lire la devise du baptême en cinq langues : espagnol, latin, quechua, aymara et pukina, langue aujourd'hui disparue.