Mit reichen Terrakotta-Dekorationen wurde das Hauptgebäude der Universität 1867 im Stil der italienischen Renaissance erbaut. Die Universität selbst wurde 1419 gegründet. Damit ist die Universität Rostock eine der ältesten in Nordeuropa und eine der 10 ältesten Universitäten in Deutschland. Die Gründungsfakultäten der Universität Rostock waren Medizin, Theologie, Rechtswissenschaften und Philosophie. Sie sind als symbolische Figuren auf vier Säulen an der Frontfassade dargestellt. Derzeit gibt es neun verschiedene Fakultäten mit über 30 Studiengängen und rund 15.000 Studenten. Die wichtigsten Studenten seit der Gründung der Universität waren der Astronom Tycho Brahe, der Archäologe Heinrich Schliemann und Schriftsteller wie Erich Kästner, Arnold Zweig und Fritz Reuter. Das Zoologische Institut der Universität Rostock befindet sich im gelben Gebäude links vom Hauptgebäude. Ein Besuch ist wegen seiner umfangreichen Tiersammlung sehr zu empfehlen.

Das Kloster zum Heiligen Kreuz ist eine vollständig erhaltene Anlage aus dem 13. und 14. Jahrhundert. Das ehemalige Zisterzienserinnenkloster wurde 1270 von der dänischen Königin Margarete gegründet. Benannt wurde das Kloster nach einem Splitter vom Kreuz Jesu Christi. Heute ist es Sitz des Kulturhistorischen Museums Rostock. Zur Klosteranlage gehören die Kirche (heute Universitätskirche), der Kreuzgang und das Refektorium. Ab 1740 entstanden im Klosterhof kleine Häuser für die Insassen des Klosters. Heute werden diese Gebäude unterschiedlich genutzt, z.B. als Kempowski-Archiv oder als Café Kloster.

Das Steintor wurde im Stil der niederländischen Renaissance (1574-1577) auf den Fundamenten des ehemaligen gotischen südlichen Haupttores errichtet. Die Feldseite ist schlicht gehalten, die prächtige Stadtseite zieren Siegel und Wappen der Stadt sowie die Inschrift „Sit intra te concordia et publica felicitas“ (In deinen Mauern herrsche Eintracht und allgemeines Wohlergehen).

Das Kröpeliner Tor, 1280 erstmals urkundlich erwähnt, ist das prächtigste der 22 Stadt- und Wassertore. Das sechsgeschossige Tor mit einer Höhe von 54 Metern ist heute ein stadtgeschichtliches Begegnungszentrum und zeigt eine Ausstellung zur Rostocker Stadtbefestigung.

St. Marien ist Rostocks schönste und bedeutendste Kirche (1230). Querschiff und Langhaus der kreuzförmigen Basilika sind gleich lang und betonen den geschlossenen Eindruck dieser gotischen Kirche. Sehenswert: z. B. Astronomische Uhr mit Umgang (1472) und bronzenes Taufbecken (1290).