Das Museum of the City of New York bietet zwei laufende Ausstellungen: die preisgekrönte Ausstellung „New York at Its Core“, eine Ausstellung in drei Galerien, die die Geschichte und Zukunft von New York City anhand von Objekten, Bildern, zeitgenössischen Videos, Fotografien und interaktiven digitalen Erlebnissen erforscht, und „Activist New York“, eine Ausstellung, die die Geschichte des Aktivismus in den fünf Bezirken in Vergangenheit und Gegenwart erzählen möchte. Außerdem sind mehrere Sonderausstellungen gleichzeitig zu sehen und der Kurzdokumentarfilm „Timescapes“, eine multimediale historische Erzählung, die die Zuschauer auf eine 28-minütige Reise durch 400 Jahre Geschichte mitnimmt. Der Film läuft alle 40 Minuten und Kopfhörer sind in Französisch, Mandarin und Spanisch verfügbar.