Die der Jungfrau Maria geweihte Hängende Kirche (Al-Muallaqa), die noch immer in Gebrauch ist, wird Hängende Kirche oder Schwebende Kirche genannt, da sie über dem Wassertor des römischen Babylons errichtet wurde. Steile Treppen führen vom Vorplatz zu einer Fassade aus dem 19. Jahrhundert, die von zwei Glockentürmen gekrönt wird.

Abu Serga (Kirche des Heiligen Sergius und Bacchus) ist eine koptisch-christliche Kirche im koptischen Viertel von Kairo. Sie ist den Heiligen Sergius und Bacchus gewidmet und ist vor allem deshalb berühmt, weil man glaubt, sie sei an dem Ort errichtet worden, an dem Josef, Maria und das Jesuskind während ihrer Zeit in Ägypten wohnten.

Die Ben-Ezra-Synagoge war einst eine christliche Kultstätte namens El-Shamieen-Kirche. Einer Legende zufolge wurde das Gebäude genau an der Stelle errichtet, an der Moses als Baby in seinem Korb gefunden wurde. Als die koptischen Christen, denen sie gehörte, jedoch die von den muslimischen Herrschern auferlegten jährlichen Steuern nicht mehr bezahlen konnten, mussten sie die Kirche verkaufen. Sie wurde an Abraham Ben Ezra verkauft, der das Gebäude 882 n. Chr. für 20.000 Dinar kaufte und es in eine jüdische Synagoge umwandelte.

Die riesige Höhlenkirche in Kairo, die früher als Kloster des heiligen Simon der Gerber bekannt war, ist eine Hommage an ein Wunder, das der heilige Simon (auch St. Samaan oder St. Simeon geschrieben) vollbracht haben soll. Die koptisch-orthodoxen Müllmänner (Zabbaleen) der Stadt gruben die Kirche in den 1970er Jahren aus dem Berg Mokattam aus.