كنيسة سيستين هي كنيسة صغيرة تقع في القصر الرسولي، المقر الرسمي للبابا، في مدينة الفاتيكان. عُرفت في الأصل باسم "كابيلا ماجنا"، وقد استُمدت اسمها من البابا سيكستوس الرابع، الذي رممها بين عامي ١٤٧٣ و١٤٨١.

تأسس متحف الفاتيكان التاريخي عام ١٩٧٣ بناءً على طلب البابا بولس السادس، وكان مقره في البداية يقع تحت ساحة الحديقة. وفي عام ١٩٨٧، انتقل إلى الطابق الرئيسي من القصر الرسولي في لاتيران حيث افتُتح في مارس ١٩٩١. وهنا سترى متحف الفاتيكان، وفناء الصنوبر، ومتحف بيو كليمنتينو، ومعرض الشمعدانات، ومعرض المفروشات، ومعرض الخرائط الجغرافية، وكنيسة سيستين، والمدخل المميز لكاتدرائية القديس بطرس.