بُنيت القلعة على نتوء صخري أسفل تلال المقطم، وهو ما جعل مهاجمتها أمرًا صعبًا. وقد مرت ثلاث فترات بناء رئيسية أدت إلى الشكل الحالي للقلعة: العصر الأيوبي في القرن الثاني عشر (بدءًا من صلاح الدين)، والعصر المملوكي في القرن الرابع عشر (في عهد الناصر محمد)، وفي القرن التاسع عشر في عهد محمد علي.

تنقسم المجموعة الدائمة إلى قسمين منفصلين، أحدهما زمني والآخر موضوعي. وتشمل الأقسام الزمنية ما يلي: الآثار القديمة، الفرعونية، اليونانية الرومانية، القبطية، العصور الوسطى، الإسلامية، الحديثة والمعاصرة. أما الأقسام الموضوعية، فتشمل ما يلي: فجر الحضارة، النيل، الكتابة، الدولة والمجتمع، الثقافة المادية، المعتقدات والفكر، ومعرض المومياوات الملكية. وقد قدمت اليونسكو الدعم الفني للمتحف. أُخذت هذه المجموعات من متاحف مصرية أخرى، مثل المتحف المصري، والمتحف القبطي، ومتحف الفن الإسلامي، وقصر ومتحف المنيل في القاهرة، ومتحف المجوهرات الملكية في الإسكندرية. في ٣ أبريل ٢٠٢١، افتُتح المتحف رسميًا، قبيل نقل ٢٢ مومياء، من بينها ١٨ ملكًا وأربع ملكات، من المتحف المصري في فعالية عُرفت باسم "موكب الفراعنة الذهبي".

يُعتقد تقليديًا أن كنيسة القديسين سرجيوس وباخوس قد بُنيت في المكان الذي استراحت فيه العائلة المقدسة، يوسف ومريم والطفل يسوع المسيح، في نهاية رحلتهم إلى مصر. ربما عاشوا هنا أثناء عمل يوسف في الحصن. للكنيسة أهمية تاريخية بالغة، وفي الواقع، انتُخب فيها العديد من بطاركة الكنيسة القبطية.

اكتشف الكنوز التاريخية للمجتمع المسيحي القبطي في هذه الجولة الخاصة التي تستغرق ثلاث ساعات في القاهرة القبطية. سافر إلى هذا الحي الآسر، المعروف أيضًا باسم القاهرة القديمة، برفقة مرشدك السياحي الخاص، وقم بزيارة مجموعة من الكنائس القديمة المزينة بالأيقونات، بما في ذلك الكنيسة المعلقة وكنيسة أبو سرجة، حيث يُقال إن العائلة المقدسة لجأت. تعرّف على التراث القبطي الغني في مصر، وقم بزيارة المتحف القبطي، كنزٌ من القطع الأثرية القديمة التي تروي قصة هذا المجتمع المسيحي، أحد أقدم المجتمعات في العالم.